Knerten og Sjøormen er den femte filmen i serien om bestevennene Lillebror og Knerten. Denne gangen reiser de på ferie med Tante Thea til Sommerøya. Der møter de Eddy som er en ekspert på alle utfordringene de kan møte på en magisk øy. Det går rykter om at det er observert en sjøorm ute i fjorden, og det tar ikke lang tid før den energiske sjøormeksperten Blegen dukker opp, med sine underlige apparater og instrumenter.Det blir en spennende sommerferie med vennskap som settes på prøve, oppdagelsesferd i naturen og jakten på den mystiske sjøormen.